EM sind ausgewählte Arten von Mikroorganismen, welche über wiegend aus Milchsäurebakterien, Hefe und einer kleinen Anzahl Photosynthesebakterien, Aktinomyzeten und fermentaktiven Pilzarten bestehen. Sie sind in einer Flüssigkeit suspendiert.

Die zusammengeführten Mikrobenstämme kommen natürlicherweise in der Umwelt vor. EM sind toxikologisch unbedenklich und enthalten keine gentechnisch veränderten Organismen.